Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms