Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDPRQ8NCN5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDPRQ8NCN5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms