Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms