Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLRC2Q8NBF2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLRC2Q8NBF2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms