Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL23Q8NBE8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL23Q8NBE8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms