Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC29Q8NA56 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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