Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U6

RNF10, RING finger protein 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF10Q8N5U6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF10Q8N5U6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms