Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
VWDEQ8N2E2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms