Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGI3Q8N145 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGI3Q8N145 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LGI3Q8N145 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LGI3Q8N145 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LGI3Q8N145 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LGI3Q8N145 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LGI3Q8N145 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LGI3Q8N145 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LGI3Q8N145 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LGI3Q8N145 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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LGI3Q8N145 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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LGI3Q8N145 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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LGI3Q8N145 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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LGI3Q8N145 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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LGI3Q8N145 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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LGI3Q8N145 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LGI3Q8N145 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms