Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM42Q8IWZ5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1139.7 ms