Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71Q8IV32 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms