Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP4Q86YS3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms