Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37DQ86XT2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms