Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC51AQ86UW1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC51AQ86UW1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC51AQ86UW1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC51AQ86UW1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC51AQ86UW1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC51AQ86UW1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC51AQ86UW1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC51AQ86UW1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC51AQ86UW1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC51AQ86UW1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC51AQ86UW1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC51AQ86UW1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms