Protein–RNA interactions for Protein: Q86UG4

SLCO6A1, Solute carrier organic anion transporter family member 6A1, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO6A1Q86UG4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO6A1Q86UG4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO6A1Q86UG4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO6A1Q86UG4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO6A1Q86UG4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO6A1Q86UG4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO6A1Q86UG4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO6A1Q86UG4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLCO6A1Q86UG4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLCO6A1Q86UG4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO6A1Q86UG4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms