Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX20Q7Z614 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms