Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms