Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP54Q7Z3B4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 501 ms