Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SETXQ7Z333 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SETXQ7Z333 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETXQ7Z333 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETXQ7Z333 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETXQ7Z333 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETXQ7Z333 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETXQ7Z333 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETXQ7Z333 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETXQ7Z333 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETXQ7Z333 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETXQ7Z333 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETXQ7Z333 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETXQ7Z333 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms