Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP45Q70EL2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP45Q70EL2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms