Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYDE1Q6ZW31 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms