Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms