Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN12Q6ZSI9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms