Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC6Q6W4X9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms