Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATF7IPQ6VMQ6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms