Protein–RNA interactions for Protein: Q6VAB6

KSR2, Kinase suppressor of Ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR2Q6VAB6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KSR2Q6VAB6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KSR2Q6VAB6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KSR2Q6VAB6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KSR2Q6VAB6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KSR2Q6VAB6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KSR2Q6VAB6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KSR2Q6VAB6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KSR2Q6VAB6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KSR2Q6VAB6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KSR2Q6VAB6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KSR2Q6VAB6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms