Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms