Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRAT1Q6PJG6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAT1Q6PJG6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms