Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF2Q6PJF5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDF2Q6PJF5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms