Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL35Q6PF15 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms