Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms