Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms