Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A1Q6PCB7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A1Q6PCB7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms