Protein–RNA interactions for Protein: Q6P0N0

MIS18BP1, Mis18-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18BP1Q6P0N0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18BP1Q6P0N0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MIS18BP1Q6P0N0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MIS18BP1Q6P0N0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MIS18BP1Q6P0N0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MIS18BP1Q6P0N0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MIS18BP1Q6P0N0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MIS18BP1Q6P0N0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MIS18BP1Q6P0N0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIS18BP1Q6P0N0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIS18BP1Q6P0N0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIS18BP1Q6P0N0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIS18BP1Q6P0N0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIS18BP1Q6P0N0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIS18BP1Q6P0N0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIS18BP1Q6P0N0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms