Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDC42EP5Q6NZY7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms