Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNP1Q6NT89 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms