Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8EQ6NSJ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms