Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms