Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RCSD1Q6JBY9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RCSD1Q6JBY9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms