Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPPQ6IPU0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms