Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms