Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms