Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms