Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CHIC1Q5VXU3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms