Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU57

AGBL4, Cytosolic carboxypeptidase 6, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL4Q5VU57 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL4Q5VU57 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL4Q5VU57 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms