Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1A1P5Q5VTE0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms