Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RNF220Q5VTB9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF220Q5VTB9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF220Q5VTB9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms