Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC38Q5VT99 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC38Q5VT99 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms