Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRAMEF5Q5TYX0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRAMEF5Q5TYX0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRAMEF5Q5TYX0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRAMEF5Q5TYX0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRAMEF5Q5TYX0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRAMEF5Q5TYX0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRAMEF5Q5TYX0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms