Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PXDC1Q5TGL8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PXDC1Q5TGL8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PXDC1Q5TGL8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PXDC1Q5TGL8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PXDC1Q5TGL8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXDC1Q5TGL8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXDC1Q5TGL8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms